Около 10 тысяч лет назад, когда таяли ледники, уровень Мирового океана постепенно повышался, вызывая значительные климатические и ландшафтные изменения. Примерно 7500 лет назад эти процессы дошли до большого пресноводного Черного озера, одного из глубоких водоемов неолитической эпохи.
Сначала через Гибралтарский пролив поднятые воды Атлантики заполнили почти пересохшее к тому времени Средиземное море, а затем двинулись к Мраморному озеру, сделав его соленым. Далее, через Босфор, морская вода попала в Черное озеро. Мощный поток соленой воды, сопровождавшийся землетрясениями и сильными ливнями, быстро поднимал уровень озера на десятки сантиметров ежедневно, пока он не сравнялся со Средиземным морем.
Морская вода изменила экосистему озера: пресноводная флора и фауна погибли, а остатки организмов начали разлагаться на дне без кислорода, создавая первые накопления сероводорода, которые сохраняются до сих пор на глубинах более 150-200 метров. Так, Черное озеро стало морем, а ниже определенного уровня, из-за высокой концентрации сероводорода, сейчас могут выживать только бактерии. Это явление сделало Черное море известным как «Море мертвых глубин».
Таким образом, стремительный приток соленой воды превратил пресноводное Черное озеро в Черное море, сформировав уникальную экосистему, которая остается неизменной по сей день.